目前三峡库区的水污染主要来自四方面：一是上游来水，特别是沱江来水水质恶劣;二是库区沿岸城镇的工业、生活污水，其中重庆市占70%～80%，重庆市每年产生的工业污水约为7～8亿吨，处理率为60%～70%，生活污水约为2亿吨，处理率不足4%;三是长江船舶所产生的垃圾、污水，据不完全统计，重庆以下、宜昌以上的长江江面有各类船舶2万多艘，每年流入江中的润滑油达3600吨，排入江中的生活污水约4万吨，产生垃圾约37万吨，旅客抛弃的塑料品数十万件;四是沿江两岸露天暴露的垃圾堆，仅重庆市便有400余处，该市日产垃圾约3万吨。